沙眼主要通过局部用药治疗，常用的药物有0.1%利福平滴眼液，一般需要持续用药数周甚至数月。
局部药物治疗
常用眼药水： 0.1%利福平滴眼液是治疗沙眼的常用药物之一，它可以抑制沙眼衣原体的生长繁殖。还有0.3%氧氟沙星滴眼液，也具有较好的抗菌作用，能有效减轻沙眼引起的炎症反应。用药频率： 通常需要频繁用药，比如白天每隔1-2小时滴1次，晚上睡觉前可涂抗生素眼膏，像红霉素眼膏等，这样能保持眼睛内的药物浓度，持续发挥作用。
全身药物治疗
适用于重症患者： 对于病情较为严重的沙眼患者，可能需要全身应用抗生素。比如口服阿奇霉素，不过需要在医生的严格指导下使用，因为全身用药要考虑药物的全身副作用等情况。
并发症的治疗
倒睫的处理： 如果沙眼导致倒睫，也就是睫毛向眼球方向生长，刺激角膜，轻度倒睫可以通过电解毛囊的方法来破坏睫毛毛囊，减少倒睫的数量；如果倒睫较多，可能需要进行手术治疗，如睑内翻矫正术等。角膜混浊的处理： 当沙眼引起角膜混浊时，如果影响视力，可能需要考虑角膜移植手术，但这是比较复杂的治疗方式，需要根据具体病情由医生评估后决定。
预防措施很重要
注意个人卫生： 要养成良好的卫生习惯，不用手揉眼睛，勤洗手，尤其是在接触公共物品后。毛巾、手帕等个人用品要专人专用，并且定期消毒。公共场所注意防护： 在公共浴室、游泳池等场所，要注意防护，避免感染沙眼衣原体。比如在公共泳池游泳后，要及时用清水清洗眼睛等。