毛囊炎主要是由细菌等病原体感染引起的。比如金黄色葡萄球菌就常是引发毛囊炎的常见致病菌，约有50% - 70%的毛囊炎是由它导致的。
细菌感染引发
金黄色葡萄球菌感染： 金黄色葡萄球菌是一种常见的细菌，它容易附着在皮肤表面，当皮肤有微小破损时，就可能侵入毛囊引发炎症。比如长期出汗多、皮肤清洁不到位的人，皮肤表面的金黄色葡萄球菌就更容易滋生，进而引发毛囊炎。表皮葡萄球菌感染： 表皮葡萄球菌也是皮肤上的常驻菌，正常情况下一般不会致病，但当皮肤屏障功能受损时，它就可能趁虚而入，感染毛囊引发毛囊炎。像皮肤受到摩擦、搔抓等损伤后，就为表皮葡萄球菌感染毛囊创造了条件。
真菌感染导致
马拉色菌感染： 马拉色菌是一种嗜脂性真菌，在油性皮肤的人群中更容易繁殖。比如青春期皮脂腺分泌旺盛的人，皮肤油脂分泌多，为马拉色菌提供了良好的生存环境，就容易引发马拉色菌性毛囊炎。一般油性皮肤人群中约30% - 50%可能受马拉色菌感染出现毛囊炎。念珠菌感染： 念珠菌属于条件致病性真菌，当人体免疫力下降或者局部环境适宜时，念珠菌就会大量繁殖感染毛囊。比如长期使用广谱抗生素、糖皮质激素的人，或者患有糖尿病等基础疾病导致免疫力低下的人，就容易发生念珠菌性毛囊炎。
其他因素诱发
皮肤卫生状况差： 不注意皮肤清洁，皮肤表面堆积过多污垢、油脂、汗液等，会为细菌、真菌等病原体的滋生提供温床，从而增加毛囊炎的发生风险。例如好几天不洗澡的人，皮肤卫生状况差，就更易长毛囊炎。机体免疫力低下： 当人体免疫力降低时，比如患有艾滋病、长期使用免疫抑制剂等情况，身体抵御病原体的能力下降，就更容易受到细菌、真菌等感染引发毛囊炎。像艾滋病患者由于免疫系统被破坏，毛囊炎的发生率比正常人要高很多。毛发牵拉、摩擦： 长期扎紧头发、穿紧身衣物等导致毛发受到过度牵拉、摩擦，会损伤毛囊，使毛囊更容易被病原体感染引发毛囊炎。比如长期扎高马尾的人，头皮部位的毛囊容易受到牵拉而引发毛囊炎；穿紧身牛仔裤的人，大腿部位的毛囊可能因摩擦而诱发毛囊炎。