女性霉菌性阴炎主要是由白色念珠菌等真菌感染引起的，约10%~20%的非孕女性及30%的孕妇阴道中有此菌寄生，但菌量少不引起症状，当全身及阴道局部免疫能力下降时，念珠菌大量繁殖才会引发炎症。
自身菌群失调导致
阴道内环境改变： 正常情况下，阴道内有多种微生物平衡存在，当长期使用广谱抗生素时，会抑制其他细菌生长，从而使念珠菌大量繁殖引发炎症。比如连续使用广谱抗生素超过1周，就增加了霉菌性阴炎的发生风险。激素变化影响： 孕妇体内雌激素水平升高，会使阴道上皮细胞内糖原含量增加，为念珠菌生长提供了良好的糖源，使得念珠菌容易繁殖致病。一般孕期尤其是孕中晚期，霉菌性阴炎的发生率会有所上升。
局部卫生状况不佳
不注意外阴清洁： 不勤换内裤、不经常清洗外阴，会导致局部潮湿，有利于念珠菌滋生。比如长时间不更换内裤，外阴局部的温度和湿度适宜念珠菌生长繁殖。内裤穿着不当： 穿紧身化纤内裤，透气性差，会使外阴局部温度和湿度升高，为念珠菌创造了有利的生存环境。比如连续2天以上穿紧身化纤内裤，就可能增加患病几率。
外界因素传播感染
接触污染物品： 使用公共浴池、浴盆、马桶等被念珠菌污染的物品，可能会间接感染霉菌性阴炎。比如在公共浴室使用了被污染的毛巾，就有感染的可能。性接触传播： 女性与携带念珠菌的男性发生性行为时，也可能被传染霉菌性阴炎。研究表明，约10%的男性生殖器中带有念珠菌，与女性发生性接触后，女性感染的风险会增加。