感冒后腰两侧疼痛可能是生理性或病理性原因导致。生理性原因主要是负重过多或劳累过度，对此要注意腰部休息，可配戴腰围保护，尽量减少下地活动和身体负重。病理性原因有多种情况：
一、因细菌或病毒感染引发全身炎症反应，从而出现腰酸疼痛症状。这时可采取对因治疗：
1.病毒感染引起的感冒，可进行抗病毒治疗或中医中药辨证治疗；
2.细菌引起的感冒，能给予抗生素抗感染治疗，常用的有青霉素类的阿莫西林、头孢类的头孢氢氨苄、大环内酯类的红霉素等。
二、感冒后链球菌感染导致的急性肾小球肾炎也会有腰疼表现，需针对链球菌感染进行治疗，对青霉素不过敏者可选用青霉素类抗生素。
三、感冒出现发热引发的腰疼痛通常是一过性的，退热治疗后症状会随温度降低而缓解。
总之，当感冒后出现腰两侧疼痛时，要仔细区分原因，采取针对性的治疗措施。如果疼痛持续不缓解或伴有其他异常症状，应及时就医检查和治疗。