消化不良的常见症状包括上腹部不适或疼痛，约有20% - 30%的消化不良患者会出现上腹部疼痛，这种疼痛没有明显的规律性，可能在进食后加重或减轻。
消化道不适症状
腹胀： 很多消化不良的人会感觉肚子胀满，尤其是进食后，这种腹胀感会比较明显，有时会持续数小时甚至一整天。比如有些人吃了一顿稍微多一点的饭，就会明显觉得肚子胀得难受，好像有气在里面不消散。早饱： 就是吃很少一点东西就觉得饱了，不想再进食。例如平时能吃一碗饭的人，现在吃半碗就感觉已经吃饱，没有食欲再继续吃了。
全身相关症状
恶心： 部分消化不良的人会有恶心的感觉，严重时可能会出现呕吐。比如有些消化不良的患者会突然觉得恶心，然后把吃进去的东西吐出来。一般恶心和呕吐的程度因人而异，有的只是稍微感觉恶心，有的则会频繁呕吐。嗳气： 经常会不自觉地打嗝，也就是嗳气。有时候在饭后或者空腹时都可能出现嗳气的情况，让人感觉很不舒服。比如坐着的时候可能会突然打个嗳气，影响周围的人。
其他伴随症状
食欲不振： 对食物的兴趣降低，不想吃东西。不管是平时喜欢的食物还是不喜欢的食物，都提不起食欲。比如原本很爱吃的水果，现在看到也没有想吃的欲望。体重变化： 如果长期消化不良，可能会导致体重有所变化。有些人会因为进食减少、营养吸收不好而体重下降；但也有少数人可能因为胃肠功能紊乱，代谢方面出现问题，体重反而增加，但这种情况相对较少见。