HPV阴性但TCT结果有问题，可能有以下原因：
1.宫颈炎症：HPV阴性只能说明没有感染HPV病毒，但不能排除宫颈炎症的可能。宫颈炎可导致宫颈细胞发生异常改变，从而影响TCT结果。此时，医生可能会建议进一步进行阴道镜检查或宫颈活检，以明确诊断。
2.宫颈上皮内瘤变（CIN）：CIN是一种癌前病变，与HPV感染无关。TCT结果异常可能提示存在CIN，但仅凭TCT结果不能确诊。医生通常会建议进行阴道镜检查和组织病理学活检，以确定病变的程度。
3.其他因素：除了上述情况外，一些其他因素也可能影响TCT结果，如宫颈涂片取材不满意、标本保存不当、患者处于生理期等。在这种情况下，医生可能会建议重新取材或等待合适的时间进行复查。
4.年龄因素：TCT检查在不同年龄段的意义不同。对于年轻女性，尤其是HPV阴性的年轻女性，TCT结果异常的可能性较小。但随着年龄的增长，宫颈癌的发生风险逐渐增加，TCT检查对于发现宫颈癌前病变和宫颈癌就显得更为重要。
5.个体差异：每个人的宫颈细胞情况都可能有所不同，即使HPV阴性，也不能完全排除宫颈病变的可能。因此，对于TCT结果异常的患者，医生会根据具体情况制定进一步的诊疗方案。
需要注意的是，TCT结果只是初步筛查，不能作为确诊依据。如果对TCT结果有疑虑，应及时咨询医生，遵循医生的建议进行进一步的检查和治疗。此外，定期进行宫颈癌筛查（包括HPV检测和TCT检查）是预防宫颈癌的重要措施，建议女性朋友们重视并积极参与。