扁桃体炎用药需根据病情来定，一般细菌感染引起的扁桃体炎，常用青霉素类抗生素，如阿莫西林，通常用药后数天内症状会有改善。
细菌感染引发的扁桃体炎用药
青霉素类药物： 阿莫西林是比较常用的青霉素类药物，它能抑制细菌细胞壁的合成，从而发挥杀菌作用，对敏感菌引起的扁桃体炎有较好疗效。头孢类药物： 头孢拉定也是常用的，属于第一代头孢菌素，对多种革兰阳性菌和阴性菌有作用，可用于扁桃体炎的治疗。
病毒感染引发的扁桃体炎用药
抗病毒药物： 如利巴韦林，它能抑制病毒核酸合成，起到抗病毒作用，但一般病毒感染引起的扁桃体炎多可自愈，病情较轻时可能仅需对症处理，严重时可考虑使用。对症缓解药物： 若有发热症状，可使用对乙酰氨基酚来退热，它能抑制前列腺素合成，达到解热镇痛效果。
特殊人群用药注意
儿童患者： 儿童使用抗生素需谨慎，比如阿莫西林，2岁以下儿童使用需遵医嘱，因为儿童的肝肾功能发育不完善，药物代谢与成人不同。孕妇患者： 孕妇患扁桃体炎用药更要小心，像头孢类药物相对较为安全，但也需在医生评估后使用，要权衡药物对胎儿的影响。
用药外的辅助措施
休息方面： 患病期间要保证充足休息，一般每天睡眠时间应保证7~8小时，让身体有恢复的体力。饮食方面： 要多喝水，每天饮水量建议在1500~2000毫升，同时饮食要清淡，避免吃辛辣、油腻等刺激性食物，如辣椒、油炸食品等，以免加重扁桃体的炎症反应。