女性雌激素水平低可能由多种因素引起，如年龄增长、内分泌疾病、生活方式等。
年龄因素
随着年龄增加，女性卵巢功能逐渐衰退，雌激素分泌量自然减少，一般在围绝经期（通常45 - 55岁左右）较为明显，这是身体自然的生理变化过程。
内分泌疾病影响
一些内分泌相关疾病会干扰雌激素的正常分泌。例如多囊卵巢综合征，患者体内激素失衡，雄激素水平相对升高，会影响雌激素的合成与代谢；甲状腺功能减退症也可能波及雌激素水平，甲状腺激素分泌异常会间接影响内分泌系统对雌激素的调控。
生活方式不当
长期的不良生活方式也可导致雌激素水平低。长期熬夜会打乱人体的生物钟，影响内分泌系统的正常运作，进而影响雌激素的分泌；过度节食、营养不良会使身体缺乏合成雌激素的必要原料，如蛋白质、脂肪等，从而导致雌激素水平降低。
医源性因素
某些医疗治疗措施也可能引起雌激素水平低。比如接受卵巢切除手术的女性，由于卵巢被移除，失去了雌激素主要的产生场所，雌激素水平会迅速下降；长期服用某些影响内分泌的药物，也可能干扰雌激素的正常代谢与分泌。