一般而言，输卵管囊肿通常无法自愈。不过要是输卵管囊肿的症状极为轻微，在炎症消退后，囊肿或许会有缩小乃至消失的可能。
一、输卵管本身结构形成的囊肿比较少见，相对常见的是输卵管系膜囊肿。
1.输卵管自身的结构较为特殊，所以由其本身结构产生的囊肿并不多见。
2.而输卵管系膜囊肿在临床上则相对更为常见。
二、临床上多数输卵管囊肿是炎症导致输卵管伞端闭锁进而形成的。
1.在临床上，大部分输卵管囊肿其实是由于炎症使得输卵管伞端闭锁。
2.这进而会造成输卵管积水或者积脓，当炎症反应逐渐消退后，脓液被组织吸收从而形成囊性结构。
三、如果输卵管和卵巢因炎症或其他原因粘连，会形成输卵管卵巢囊肿。
1.当输卵管和卵巢因为炎症或一些其他因素而发生粘连时。
2.就可能会形成输卵管卵巢囊肿。
总之，输卵管囊肿一般难以自愈，只有在症状特别轻微的情况下，才有可能出现囊肿缩小或消失的情况。