输卵管囊肿一般不会自愈，需要进行治疗。
输卵管囊肿是一种良性疾病，通常是由于输卵管炎症、感染或损伤等原因导致输卵管管腔扩张而形成的。较小的输卵管囊肿可能没有明显症状，但较大的囊肿可能会引起下腹疼痛、月经失调、性交痛等不适。
治疗输卵管囊肿的方法主要包括以下几种：
1.观察等待：对于较小的、没有症状的输卵管囊肿，医生可能会建议观察等待，定期进行超声检查，以了解囊肿的大小和变化情况。
2.药物治疗：如果输卵管囊肿是由于炎症引起的，医生可能会开具抗生素或消炎药进行治疗。
3.手术治疗：手术治疗是治疗输卵管囊肿的主要方法，包括腹腔镜手术和开腹手术。手术的目的是切除囊肿，恢复输卵管的正常结构和功能。
需要注意的是，输卵管囊肿可能会影响女性的生育能力，因此如果有生育需求，应在医生的指导下进行治疗。此外，输卵管囊肿也有恶变的可能，因此定期复查也非常重要。
总之，输卵管囊肿一般不会自愈，需要及时就医，根据具体情况选择合适的治疗方法。