嘴巴里面溃疡的原因有多种。一般来说，复发性阿弗他溃疡较为常见，其发生可能与遗传、免疫、环境等因素有关，约有40%的人有家族遗传史。
局部创伤因素
口腔内异物摩擦：比如牙齿残根、残冠或者不合适的假牙，会不断摩擦口腔黏膜，从而引发溃疡。通常这种情况在去除刺激因素后，溃疡会逐渐好转，但如果长期不处理，溃疡可能会反复不愈。例如，有患者因为长期佩戴不合适的假牙，口腔内对应部位反复出现溃疡。咬伤口腔黏膜：吃饭时不小心咬伤口腔黏膜，也容易形成溃疡。一般这种咬伤导致的溃疡，如果伤口不大，大约7 - 10天能自行愈合，但如果咬伤较深或者反复咬伤同一部位，愈合时间会延长。
全身因素
缺乏维生素：当人体缺乏维生素B12、叶酸、铁、锌等营养素时，容易出现口腔溃疡。比如长期吃素的人，若饮食搭配不合理，就可能缺乏B族维生素，进而引发口腔溃疡。有研究表明，约30% - 50%的复发性口腔溃疡患者存在不同程度的维生素缺乏情况。免疫系统异常：自身免疫力低下时，容易受到病原体侵袭，引发口腔溃疡。像患有自身免疫性疾病（如白塞病）的患者，口腔溃疡往往是其典型症状之一，而且溃疡容易反复发作，病情较为顽固。
精神因素
长期压力大：长期处于精神紧张、焦虑、抑郁等状态下，会影响人体的神经内分泌系统，进而影响免疫系统和口腔黏膜的代谢，导致口腔溃疡发生。比如学生在考试期间，由于学习压力大，容易出现口腔溃疡；上班族长期工作压力大，也可能反复长口腔溃疡。据统计，约60%的口腔溃疡患者在发病前有精神压力过大的情况。睡眠不足：长期睡眠不足会打乱人体的生物钟，影响身体的正常代谢和修复功能，使得口腔黏膜的抵抗力下降，容易长溃疡。一般来说，成年人每天需要保证7 - 8小时的充足睡眠，若长期睡眠少于6小时，患口腔溃疡的风险会明显增加。