两个大脚趾指甲有横纹并且凹陷，可能与以下原因有关。
1.甲营养不良：如果身体缺乏维生素、微量元素等营养物质，可能会导致指甲营养不良，出现指甲横纹、凹陷等症状。此外，扁平苔藓、银屑病等疾病也可能影响指甲的正常生长，导致指甲出现异常。
2.真菌感染：灰指甲（甲癣）是由真菌感染引起的，甲板会出现增厚、变色、变形等症状，严重时甲板可能会与甲床分离，出现指甲凹陷、横纹等情况。
3.外伤：脚趾甲受到挤压、碰撞等外伤后，可能会导致甲板下出血，出现指甲变黑、凹陷等情况。随着指甲的生长，淤血会逐渐排出，指甲会恢复正常。
4.其他：系统性疾病如银屑病、扁平苔藓等，也可能影响指甲的健康，导致指甲出现异常。
如果发现指甲有横纹、凹陷等异常，建议及时就医，进行相关检查，以明确原因。如果是甲营养不良，需要注意饮食均衡，多摄入富含维生素、微量元素的食物。如果是真菌感染，需要使用抗真菌药物进行治疗。如果是外伤导致，一般不需要特殊处理，随着指甲的生长会逐渐恢复正常。如果是其他疾病引起的，需要针对原发病进行治疗。