直肠息肉的治疗方法需根据息肉的大小、形态、病理类型等因素来定。一般来说，较小的息肉可通过内镜下切除等方式处理。
内镜下切除治疗
小息肉内镜下摘除：对于直径小于2厘米的良性息肉，常可在内镜下用圈套器等工具将息肉完整摘除。这种方法创伤小，患者恢复较快，一般术后观察1 - 2天若无异常即可出院。内镜下黏膜切除术（EMR）：适用于较大一些但无浸润的息肉。通过注射生理盐水使病变黏膜隆起，然后用圈套器切除。
手术治疗情况
息肉较大或有恶变倾向时：如果息肉直径大于2厘米，或者病理检查提示有恶变潜能，可能需要进行外科手术切除。例如，经肛门息肉切除术，适用于距离肛门较近的息肉；对于位置较高的较大息肉，可能需要开腹或腹腔镜下手术切除。
随访观察情况
良性小息肉定期复查：如果是体积很小、病理明确为良性的息肉，医生可能会建议定期复查肠镜，观察息肉有无复发等情况。一般建议3 - 6个月复查一次肠镜，连续2 - 3次检查无异常后，可适当延长复查间隔时间。比如，首次发现一个很小的良性直肠息肉，医生会告知患者3个月后复查肠镜，查看息肉有无变化。特殊类型息肉的特殊处理：如家族性息肉病等遗传性息肉病，一般需要更积极的治疗和密切随访。这类患者往往肠道内会有大量息肉，可能需要多次内镜下治疗或外科手术切除部分肠道等综合治疗措施。