直肠息肉的治疗方法需根据息肉的类型、大小、数量等因素来定。一般来说，较小的良性息肉可通过内镜下切除等方式处理，而较大或有恶变倾向的可能需要手术切除。
内镜下切除治疗
小息肉内镜切除：对于直径小于2厘米的良性直肠息肉，常可在内镜下进行切除。比如直径在0.5~1厘米左右的息肉，可通过内镜下的圈套器切除，操作相对简便，患者痛苦较小。多发息肉内镜处理：如果是多个直肠息肉，也可以在内镜下分次或一次切除。但要注意操作时要尽量完整切除每个息肉，且避免对肠道黏膜造成过大损伤。
手术切除治疗
大息肉或恶变倾向息肉手术：当直肠息肉较大，直径超过2厘米，或者怀疑有恶变倾向时，多需要进行手术切除。例如息肉基底较宽，内镜下切除困难的情况，就需要开腹或腹腔镜下手术切除。手术会将息肉所在的部分肠道组织切除，以确保彻底清除病变。复发息肉再手术：如果直肠息肉切除后有复发情况，且复发息肉符合手术指征，也需要再次考虑手术治疗。
观察随访情况
小良性息肉观察：对于一些非常小的、良性可能性极大的直肠息肉，比如直径小于0.5厘米的炎性息肉等，有时可以先进行观察随访。一般建议每隔6~12个月进行一次肠镜复查，观察息肉是否有变化。如果息肉没有增大、恶变等情况，可继续观察。特定人群随访：像年龄较大、基础疾病较多的患者，对于一些较小的直肠息肉，医生可能会更倾向于先观察随访，因为手术也有一定风险。而年轻、身体状况较好的患者，如果息肉有一定风险因素，可能会建议积极处理。