双肾结石的治疗方式需根据结石大小、症状等因素来定。一般来说，直径小于0.6厘米的结石，有自行排出的可能。
药物治疗方面
排石药物： 可以使用一些促进结石排出的药物，比如枸橼酸氢钾钠颗粒等，它能调节尿液酸碱度，有助于小结石的溶解和排出，但要在医生指导下使用。溶石药物：对于某些特定成分的结石，像尿酸结石，可以使用别嘌醇等药物来降低尿酸水平，辅助结石溶解，但药物使用需严格遵循医嘱。
手术治疗情况
体外冲击波碎石： 如果结石直径在0.6~2厘米之间，且适宜体外冲击波碎石，通过体外产生的冲击波聚焦于结石处，将结石击碎，使其随尿液排出体外。一般来说，单次体外冲击波碎石费用大概在1000~2000元左右，但具体费用因地区和医院有所不同。输尿管镜取石术：当结石较大，体外冲击波碎石效果不佳或结石位置较为特殊时，可采用输尿管镜取石术。手术需住院，一般住院时间约3~7天，费用大概在1万~2万元左右，具体费用与医院等级等因素有关。经皮肾镜取石术：对于较大的肾结石，直径大于2厘米的，经皮肾镜取石术是常用方法。手术创伤相对较大，住院时间可能在1周左右，费用大概在2万~3万元不等，具体费用因结石复杂程度等因素有差异。
生活方式调整
增加饮水量： 双肾结石患者每天饮水量应保持在2000~3000毫升以上，大量饮水可以增加尿量，促进小结石的排出，还能稀释尿液，减少结石形成的机会。饮食调整：要限制高草酸食物的摄入，比如菠菜、甜菜、巧克力等，高草酸食物容易促进结石形成；还要减少高嘌呤食物的摄入，像动物内脏、海鲜等，因为嘌呤代谢产物会增加尿酸，与结石形成相关；同时要控制高钙食物的过量摄入，不过也不能过度限制钙的摄入，以免导致其他问题。