胃底胃壁增厚一般不能自愈，需要明确病因后进行针对性处理。引起胃底胃壁增厚的原因较多，不同病因的处理方式不同。
一、炎症性因素导致的胃底胃壁增厚
幽门螺杆菌感染引起的炎症：幽门螺杆菌感染是常见原因之一，若不治疗，炎症持续存在，胃底胃壁增厚不会自行消退。需要进行幽门螺杆菌根除治疗，常用方案是质子泵抑制剂（如奥美拉唑等）+铋剂+两种抗生素（如阿莫西林、克拉霉素等）联合治疗。自身免疫性胃炎导致的胃底胃壁增厚：自身免疫反应持续存在，胃底胃壁增厚也不会自愈。治疗上可能需要使用一些调节免疫的药物等进行干预，并且要定期监测胃部情况。
二、肿瘤性因素导致的胃底胃壁增厚
胃息肉导致的胃底胃壁增厚：胃息肉一般不会自行消失，若不处理可能会有恶变风险。通常需要在内镜下进行息肉切除等治疗。胃癌导致的胃底胃壁增厚：胃癌是恶性病变，肯定不会自愈，需要根据病情分期等情况采取手术、化疗、放疗等综合治疗措施。
三、其他因素导致的胃底胃壁增厚
胃静脉曲张导致的胃底胃壁增厚：胃静脉曲张不会自行消退，需要针对病因进行治疗，比如对于门静脉高压引起的胃静脉曲张，可能需要采取降低门静脉压力等治疗手段，如使用药物降低门静脉压力等，严重时可能需要介入等治疗方式。胃间质瘤导致的胃底胃壁增厚：胃间质瘤一般也不会自愈，通常需要根据肿瘤的大小、部位等情况考虑手术切除等治疗。