睫毛根部长小水泡可能是睑板腺堵塞或睑缘炎导致。
一、睑板腺堵塞
睫毛根部即睑板腺位置，当睑板腺堵塞且分泌物堆积时会形成囊肿，表现为出现小水泡，部分患者还可能伴有眼睛发涩、眼部有异物感等情况。睑板腺堵塞通常不会影响视力，患者可通过热毛巾湿敷、热气熏蒸、用棉签按摩等方式来帮助疏通睑板腺，也可使用一些消炎类眼膏以防止感染，一般三到五天小水泡就会消退。
二、睑缘炎
如果睫毛根部长小水泡并伴有疼痛化脓，那就可能是睑缘炎引起。可以使用糖皮质激素来进行控制，同时还可辅助以热敷按摩。患者需要保证充足的休息，减少用眼，不佩戴隐形眼镜，不画内眼线。
总之，当发现睫毛根部长小水泡时，要根据具体症状判断是哪种原因导致的，然后采取相应的处理措施。如果症状持续不缓解或加重，应及时就医。