睫毛根部的小水泡可能是由以下原因引起的：
1.睑腺炎：睫毛根部的皮脂腺或汗腺被细菌感染，导致睑腺炎，从而出现小水泡。
2.过敏：如果对化妆品、洗发水、睫毛膏等过敏，可能会引起过敏反应，导致睫毛根部出现小水泡。
3.疱疹：单纯疱疹病毒感染可引起口唇疱疹，若累及睫毛根部，也会出现小水泡。
针对不同的病因，治疗方法也有所不同：
1.睑腺炎：
局部热敷：每天热敷3~4次，每次10~15分钟，有助于炎症消退。
涂抹抗生素眼膏：如红霉素眼膏、金霉素眼膏等，涂在眼皮上，覆盖在小水泡上。
口服抗生素：如果症状严重，医生可能会建议口服抗生素。
2.过敏：
避免接触过敏原：找出并避免接触过敏原是最好的治疗方法。
局部冷敷：用冷毛巾或冰袋敷在眼皮上，可减轻瘙痒和红肿。
涂抹抗过敏药物：如氢化可的松眼膏，可缓解过敏症状。
3.疱疹：
局部涂抹抗病毒药物：如阿昔洛韦眼膏、更昔洛韦眼用凝胶等，可抑制病毒复制。
口服抗病毒药物：如果症状严重，医生可能会建议口服抗病毒药物。
注意眼部卫生：避免揉眼，以免感染扩散。
需要注意的是，如果小水泡持续不愈、症状加重或出现其他不适，应及时就医，以便明确病因并采取相应的治疗措施。同时，要保持眼部清洁，避免用眼过度，避免食用辛辣刺激性食物。