孕后期臀部两侧骨头痛，主要涉及以下原因：
一、胎儿或羊水负荷过重，使后侧骶髂关节负担增加，引发骶髂关节周围炎症，导致此处疼痛。这是因为到了孕后期，随着胎儿的不断发育以及羊水的增多，会对孕妇身体造成较大的负担，而后侧骶髂关节首当其冲，在长期过重的负荷下，就容易诱发炎症，进而产生明显的疼痛。
二、可能与骨质疏松有关。胎儿生长过程中大量消耗母体钙质，若孕妇营养跟不上，就易出现骨质疏松，从而引起腰椎、骨盆及下肢等部位出现骨性疼痛。在孕期，胎儿对钙质的需求较大，会不断从母体摄取，而如果孕妇不能及时补充足够的钙质及其他营养物质，自身的骨密度就会下降，导致骨质疏松，这种情况下，身体的多处骨骼包括臀部两侧都可能有疼痛表现。
三、患者长时间挺起腹部，会造成臀部及腰骶部位肌肉疲劳，产生酸痛，有时会被误认为是骨性疼痛。孕妇为了保持身体平衡和保护胎儿，会长期保持特定的姿势，这就容易让臀部和腰骶部的肌肉一直处于紧张状态，久而久之就会因疲劳而产生酸痛感，这种酸痛可能会被误判为骨性疼痛。
四、可能在妊娠后期出现腰椎间盘突出或坐骨神经痛等周围神经病变，从而引起放射性疼痛，让患者误以为是骨性疼痛。在孕后期，孕妇身体的变化以及负担的加重等多种因素，可能诱发腰椎间盘突出等问题，这些问题会压迫神经，引起疼痛沿着神经放射，使臀部两侧出现疼痛，而患者可能将其误认为是骨头本身的疼痛。
总之，孕后期臀部两侧骨头痛可能由多种因素引起，需要结合具体情况进行综合分析和判断。