会厌囊肿的治疗方式主要有手术治疗和观察随访两种。对于较大的会厌囊肿，一般会采取手术切除，手术多在支撑喉镜下进行，操作相对简单，通常1周左右可恢复。
手术治疗方式
支撑喉镜下囊肿切除术：这是较为常用的手术方法。通过支撑喉镜暴露会厌囊肿，然后用激光、电刀等将囊肿切除。这种手术创伤相对较小，术后恢复较快。一般在术后需要禁声1 - 2天，以利于手术创面的恢复。显微镜下会厌囊肿切除术：对于位置较深、解剖结构复杂部位的会厌囊肿，可借助显微镜进行手术。显微镜能提供更清晰的视野，有助于精准切除囊肿，减少对周围组织的损伤，但手术操作相对复杂一些，术后恢复时间可能与支撑喉镜下手术类似，但具体恢复时间也因个体差异有所不同。
观察随访情况
小囊肿且无症状者：如果会厌囊肿较小，患者也没有任何不适症状，比如没有喉咙异物感、呼吸困难等情况，可以选择观察随访。一般建议每隔3 - 6个月进行一次喉镜检查，观察囊肿的大小变化。如果在观察期间囊肿没有明显增大，也没有出现相关症状，可以继续观察。囊肿较小但有轻度症状者：若会厌囊肿较小，但患者有轻微的喉咙异物感等不适，也可以先尝试观察随访。同时要注意避免过度用嗓，减少对喉咙的刺激。在观察过程中，如果症状加重或者囊肿有增大趋势，就需要考虑手术治疗。
术后注意事项
饮食方面：术后短期内要避免食用辛辣、刺激性食物，如辣椒、花椒等，也不宜吃太烫的食物，以免刺激手术创面。可以先吃一些温凉的流质或半流质食物，如米粥、蛋羹等，待创面恢复后再逐渐过渡到正常饮食。一般术后1周左右可基本恢复正常饮食，但仍要注意保持饮食清淡。口腔卫生：要保持口腔清洁，饭后及时漱口，防止食物残渣残留引起感染。可以使用生理盐水或漱口水漱口，每天漱口3 - 4次，有助于保持口腔卫生，促进手术创面的愈合。