孕期做亲子鉴定主要有两种方式，分别是无创胎儿亲子鉴定和羊水穿刺亲子鉴定。
无创胎儿亲子鉴定
一般在孕期12周以上可进行，通过采集孕妇外周血，利用新一代DNA测序技术对游离DNA片段进行测序分析，从而判断胎儿与假定父亲的亲缘关系。其原理是孕妇外周血中含有胎儿游离DNA，能通过检测这些DNA来进行鉴定，该方法对孕妇和胎儿创伤小。
羊水穿刺亲子鉴定
通常在孕期16 - 22周进行，需要抽取羊水，提取羊水中胎儿的细胞，进而进行DNA检测。此方法是通过获取胎儿的细胞来分析DNA，能较为准确鉴定亲子关系，但相对无创胎儿亲子鉴定有一定操作风险，可能会有导致流产等情况的潜在风险，不过发生概率较低。需要注意的是，无论是哪种方式都要选择正规的鉴定机构进行，以确保鉴定结果的准确性。同时，在进行相关鉴定前，应充分了解其风险和注意事项，尤其是羊水穿刺亲子鉴定，要在医生的专业评估下决定是否适合进行。