龟头上有小疙瘩通常见于以下这些病因：
一、珍珠状阴茎丘疹：
1.这是位于阴茎冠状沟处、环绕龟头出现的淡红色小丘疹。
2.丘疹顶端圆且光滑，个别呈毛状或丝状。丘疹互不融合，多密集排列呈一行或多行，在龟头背侧较为明显，部分或完全环绕龟头。颜色多为珍珠状白色，少数为淡红色、肤色，部分还会出现轻度红肿。
3.无疼痛、无破溃，患者通常无明显自觉症状。常发生于成年人，一般以20至40岁居多。多见于包皮过长和有手淫习惯的青年人。属于生理性异常，并非性病范畴。
二、包皮龟头炎：
1.念珠菌性包皮龟头炎多见于包皮过长且有不洁性交史的情况，阴茎包皮、龟头会轻度潮红，包皮内板及龟头冠状沟处可能有白色奶酪样分泌物，龟头可有针头大小淡红色丘疹，若侵犯包皮外面及阴囊，可见鳞屑性红斑。如舟状窝累及则可能有尿频、尿痛等症状。
2.局部会有烧灼感及瘙痒等表现。偶尔还会发生暴发性水肿性包皮龟头炎，主要表现为阴茎包皮明显水肿、剧痒，有浅在溃疡。
三、尖锐湿疣：
1.初期为细小淡红色丘疹，之后逐渐增大增多，单个或群集分布，湿润柔软，表面凹凸不平，呈乳头样、鸡冠状或菜花样突起，触摸起来有疙瘩样的感觉。
2.根部常有蒂，且易发生糜烂渗液，触之易出血。皮损裂缝间常有脓性分泌物郁积，致有恶臭，且可因搔抓而引起继发感染。本病常无自觉症状，部分病人可出现异物感、痛、痒感或性交痛。
总结概况提示：龟头上小疙瘩的出现可能与珍珠状阴茎丘疹、包皮龟头炎、尖锐湿疣等有关，各自有其典型的症状表现，需仔细鉴别诊断。