腓总神经损伤的治疗方法需根据损伤程度等因素来定。一般来说，轻度的腓总神经损伤可以先通过保守治疗等方式来促进恢复，而严重的可能需要手术治疗。
保守治疗方式
物理治疗：
针灸推拿： 通过针灸刺激相关穴位，以及推拿手法来改善局部血液循环，促进神经修复。一般需要坚持一段时间的治疗，比如每周进行2 - 3次针灸推拿，持续数周甚至数月。康复训练： 进行足背屈、外翻等运动训练，帮助维持肌肉力量和关节活动度。患者可以在康复治疗师的指导下，每天进行数次训练，每次训练10 - 15分钟左右，逐渐增加训练强度。
药物辅助治疗
神经营养药物：
维生素B族： 像维生素B12（甲钴胺）就可以起到营养神经的作用，有助于促进神经的修复。甲钴胺一般可以口服，也可以肌肉注射，口服时一般每次0.5毫克，每天3次左右。神经生长因子： 一些药物可以促进神经细胞的生长和修复，但这类药物的使用需要在医生的严格评估下进行，并且可能会有一定的费用，一般需要根据患者的具体情况来决定是否使用。
手术治疗情况
手术指征：
当腓总神经损伤是由骨折等原因导致神经受到卡压，且保守治疗3 - 6个月后神经功能仍无明显恢复迹象时，通常需要考虑手术治疗。例如，因骨折碎片压迫腓总神经，经过一段时间保守治疗后神经功能没有改善，就需要通过手术解除压迫。
手术方式：
常见的手术有神经松解术，就是将受压的神经松解开来，恢复神经的正常位置和功能；如果神经损伤严重，可能还需要进行神经吻合术等，将受损的神经两端进行吻合，促进神经再生。但手术也存在一定风险，比如感染、神经再次损伤等风险。