脊柱炎的引起原因较为复杂，其中遗传因素是一个重要方面，有研究表明，约90%的强直性脊柱炎患者与人类白细胞抗原B27（HLA - B27）基因相关，HLA - B27阳性人群患强直性脊柱炎的风险比阴性人群高很多。
遗传因素相关
HLA - B27基因关联： 大量的医学研究发现，HLA - B27基因在强直性脊柱炎的发病中起到关键作用。如果家族中有亲属患有强直性脊柱炎，那么家族成员携带HLA - B27基因的概率会增加，进而患脊柱炎的风险也相应升高。遗传易感性传递： 这种遗传易感性会通过基因在家族中传递，不过并不是携带了HLA - B27基因就一定会发病，只是发病的几率比正常人群高很多。
感染因素影响
肠道细菌感染： 一些肠道细菌与脊柱炎的发病有关联。比如肺炎克雷伯杆菌等肠道细菌，它们的某些成分可能会与人体自身组织产生交叉免疫反应，从而引发脊柱炎相关的炎症反应。泌尿生殖道感染： 泌尿生殖道的某些病原体感染也可能参与脊柱炎的发病过程。例如衣原体等病原体感染后，可能会激活人体的免疫系统，导致脊柱等部位出现炎症病变。
免疫因素作用
免疫系统异常激活： 人体的免疫系统在正常情况下会抵御外来病原体的入侵，但在脊柱炎患者体内，免疫系统会出现异常激活的情况。免疫系统错误地攻击自身的脊柱等关节组织，导致炎症的产生，进而引发脊柱炎。炎症介质参与： 在免疫异常激活的过程中，会有多种炎症介质参与其中，如肿瘤坏死因子 - α等。这些炎症介质会促使脊柱关节部位发生炎症反应，导致关节疼痛、僵硬等脊柱炎的相关症状出现。