精索静脉曲张主要是由于精索内静脉回流受阻或瓣膜功能不良等原因引起。据统计，在普通男性人群中，精索静脉曲张的发生率约为10%~15%，而在不育男性中，发生率可高达35%左右。
解剖结构因素导致
静脉瓣功能不全：精索内静脉有多个瓣膜，起到防止血液逆流的作用。如果这些瓣膜发育不全、缺失或功能异常，就容易导致血液逆流，使静脉丛淤血扩张，引发精索静脉曲张。比如左侧精索内静脉呈直角注入左肾静脉，血液回流阻力相对较大，且左侧静脉瓣功能不全的发生率较高，所以左侧精索静脉曲张更为常见。解剖位置影响：左侧精索内静脉行程较长，经过乙状结肠后方，受到肠道压迫的机会较多，也会影响血液回流，增加精索静脉曲张发生的可能性。
生理因素引发
站立过久：长时间站立会使下肢静脉回流压力增加，对于精索内静脉来说，也会相应增加回流负担。比如一些长期从事站立工作的人群，像教师、理发师等，精索静脉曲张的发生率相对会高一些。一般连续站立超过2小时，就可能对精索静脉回流产生明显影响。性活动频繁：青春期后性器官迅速发育，性活动频繁，性冲动反复出现，会造成性器官反复充血，也可能导致精索静脉回流受阻，从而诱发精索静脉曲张。尤其是15~30岁的青壮年，性活动较频繁，该年龄段精索静脉曲张的发生率相对较高。
其他因素关联
腹膜后病变：如腹膜后肿瘤、肾肿瘤等，可压迫精索内静脉，引起症状性或继发性精索静脉曲张。肿瘤压迫导致静脉回流通道受阻，血液淤积在精索静脉内，逐渐就会形成精索静脉曲张。这种情况相对较为少见，但也需要引起重视。遗传因素：精索静脉曲张有一定的遗传倾向。如果家族中有亲属患有精索静脉曲张，那么其自身患病的风险可能会增加。研究发现，部分精索静脉曲张患者存在遗传基因突变，导致静脉壁薄弱等结构异常，从而容易发生精索静脉曲张。