霉菌阴道炎主要由假丝酵母菌引起，治疗通常以抗真菌药物为主，一般规范治疗1-2周可取得较好效果。
药物治疗选择
局部用药： 常用的有克霉唑制剂，如克霉唑栓，每晚1粒（150mg），连用7日；或克霉唑栓1粒（500mg）单次用药。还有咪康唑制剂，咪康唑栓200mg，每晚1粒，连用7日；或400mg，每晚1粒，连用3日；或1200mg单次用药。另外，制霉菌素制剂也可选用，制霉菌素栓10万U，每晚1粒，连用14日。全身用药： 对于不能耐受局部用药、未婚女性及不愿采用局部用药者，可选用口服药物。常用药物有氟康唑，150mg单次口服。
生活方式调整
保持外阴清洁干燥： 每天用清水清洗外阴，保持外阴清洁，但是要注意避免过度清洗，以免破坏阴道的正常菌群。清洗后的毛巾、内裤等物品要放在通风处晾干，最好阳光下暴晒，以达到杀菌的作用。一般建议每天更换内裤，选择棉质、宽松的内裤，有利于保持外阴透气。避免滥用抗生素： 长期大量使用抗生素会抑制阴道内乳酸杆菌的生长，破坏阴道的微生态环境，从而容易引发霉菌阴道炎。所以在使用抗生素时要严格遵循医嘱，不要自行增减药量或延长用药时间。如果因病情需要必须长期使用抗生素，要密切关注阴道的不适症状，一旦出现异常及时就医。
性伴侣治疗
男性伴侣一般无需常规治疗： 但如果男性伴侣有龟头炎症状，需要进行假丝酵母菌检查及治疗，以预防女性重复感染。男性可以用清水清洗阴茎，保持局部清洁，如果有感染症状，可遵医嘱使用抗真菌药物局部涂抹。治疗期间避免性生活： 在霉菌阴道炎治疗期间，要避免性生活，以免交叉感染，影响治疗效果。即使症状缓解后，恢复性生活时也建议使用避孕套，减少再次感染的风险。
特殊人群注意事项
孕妇： 孕妇患霉菌阴道炎时，治疗以局部用药为主，尽量避免口服药物。可选用对胎儿影响较小的克霉唑制剂等局部用药，以缓解症状。治疗时要遵循医生的建议，规范用药，同时要注意保持外阴清洁，按照医生的要求定期复查。糖尿病患者： 糖尿病患者由于血糖控制不佳时，阴道内糖原含量升高，适合假丝酵母菌生长繁殖，容易反复发生霉菌阴道炎。这类患者除了积极治疗霉菌阴道炎外，要严格控制血糖，通过饮食控制、适当运动以及必要时的药物治疗等，将血糖控制在合理范围内，从根本上减少霉菌阴道炎的复发几率。