子宫畸形主要是胚胎发育时期出现异常导致的。在胚胎发育的第6 - 10周，生殖嵴两侧的副中肾管会逐渐发育、融合、吸收，形成子宫和阴道上段。如果这个过程受到某些因素干扰，就会引起子宫畸形。
遗传因素相关
染色体异常影响： 部分子宫畸形与染色体异常有关。比如，一些遗传性综合征可能伴随子宫畸形，有研究发现某些特定染色体数目或结构的改变，会干扰副中肾管的正常发育过程。例如，特纳综合征患者常伴有子宫发育异常的情况。家族遗传倾向： 如果家族中有亲属曾出现子宫畸形，那么后代发生子宫畸形的风险可能会相对增高。虽然具体遗传机制还在研究中，但遗传因素在子宫畸形的发生中起到一定作用。
胚胎发育时期的外界因素影响
药物影响： 在胚胎发育关键时期（怀孕早期），如果孕妇服用了某些不当药物，可能干扰副中肾管的正常融合等过程。比如，孕期误用了一些影响胚胎发育的激素类药物等，就可能增加子宫畸形的发生几率。化学物质接触： 孕妇在孕期接触一些有害化学物质，像某些工业污染物、农药残留等，也可能对胚胎发育产生不良影响，导致子宫畸形。例如，长期处于含有苯类等有害化学物质环境中的孕妇，其腹中胎儿发生子宫畸形的风险可能升高。
疾病因素干扰
内分泌紊乱： 孕妇在孕期如果自身内分泌出现紊乱，如孕激素、雌激素等分泌异常，会影响胚胎的正常发育。例如，孕期甲状腺功能异常，甲状腺激素分泌不足或过多，都可能干扰副中肾管的发育进程，进而引发子宫畸形。母体疾病影响： 孕妇在孕前或孕期患有某些疾病，也可能影响子宫畸形的发生。比如，孕妇患有糖尿病且血糖控制不佳时，高血糖环境可能干扰胚胎发育，增加子宫畸形的发生风险。