重症病毒性脑炎留下的后遗症包括：意识丧失、肢体活动异常、颅内压增高、瞳孔大小不一、呼吸节律不规则、抽搐甚至演变为癫痫、肢体瘫痪、智力落后、发育迟缓等。
一、意识丧失：中枢神经系统感染可能严重影响大脑功能，导致患者失去意识，无法对外界刺激做出正常反应。
二、肢体活动异常：这可能表现为肢体的无力、僵硬、不协调或不自主运动等，影响患者的行动能力。
三、颅内压增高：脑部炎症可引起颅内压升高，出现头痛、呕吐等症状。
四、瞳孔大小不一：可能反映出神经系统的损伤和功能异常。
五、呼吸节律不规则：说明呼吸中枢受到影响，干扰正常的呼吸模式。
六、抽搐：病情严重时可能引发抽搐，长时间反复发作可能演变为癫痫。
七、肢体瘫痪：使患者的肢体失去正常运动功能。
八、智力落后、发育迟缓：对大脑发育产生不良影响，导致智力水平低于正常或发育进程滞后。
对于这些后遗症，需要进行长期的康复锻炼和营养脑神经治疗。康复锻炼有助于改善肢体功能和提高生活自理能力，营养脑神经治疗则能在一定程度上促进大脑的恢复和修复。总之，这是一个需要耐心和坚持的漫长过程。