肠易激综合症的治疗药物需根据不同症状来选择。一般来说，缓解腹痛的药物常用匹维溴铵，它能选择性作用于胃肠道平滑肌，可在一定程度上改善腹痛症状。
缓解腹痛类药物
匹维溴铵： 这是一种选择性的胃肠道平滑肌钙通道阻滞剂，能特异性地作用于胃肠道平滑肌，缓解肠道痉挛引起的腹痛，它不影响食管下部括约肌压力，也不引起低血压等全身不良反应。曲美布汀： 可调节胃肠道运动功能，对胃肠道平滑肌有双向调节作用，既能抑制运动亢进肌群的运动，又能增强运动功能低下肌群的运动，从而改善肠易激综合症患者的腹痛、腹胀等症状。
调节肠道菌群类药物
双歧杆菌四联活菌片： 含有双歧杆菌、嗜酸乳杆菌、粪肠球菌、蜡样芽孢杆菌等多种有益菌，能补充肠道有益菌群，调整肠道菌群失调，改善肠易激综合症患者肠道功能紊乱的情况，维持肠道正常的生理功能。枯草杆菌二联活菌颗粒： 包含枯草杆菌和肠球菌，可直接补充正常生理菌群，抑制致病菌的生长繁殖，调整肠道菌群，对肠易激综合症引起的腹泻、便秘等症状有一定的调节作用。
缓解腹泻类药物
洛哌丁胺： 是一种强效的抗腹泻药物，作用于肠壁的阿片受体，抑制肠道平滑肌的收缩，减少肠蠕动，延长肠内容物的通过时间，从而起到止泻的作用，但需注意不能长期大剂量使用。复方地芬诺酯： 由地芬诺酯和阿托品组成，地芬诺酯有较弱的阿片样作用，但无镇痛作用，可直接作用于肠平滑肌，通过抑制肠黏膜感受器，消除局部黏膜的蠕动反射而减弱蠕动，阿托品可协同加强地芬诺酯的止泻作用，但要警惕阿托品的不良反应。
缓解便秘类药物
乳果糖口服溶液： 是一种合成的双糖，在肠道内不被吸收，可被肠道细菌分解为乳酸和醋酸，使肠道pH值降低，通过渗透作用增加肠道内水分，刺激肠道蠕动，缓解便秘症状，适用于肠易激综合症伴便秘的患者。聚乙二醇4000散： 口服后不被肠道吸收，也不参与代谢，通过保留水分，增加粪便体积，使粪便变软，易于排出，从而缓解便秘，可用于改善肠易激综合症患者的便秘情况。