3个月小宝贝低烧的原因可能有受凉或感冒、病毒感染、细菌感染等。对此可先积极进行物理降温，若无效则需及时就医并根据病因进行干预处理。
一、受凉或感冒：
1.受凉、感冒可能引发肠胃不适，从而导致低烧。
2.因3个月小宝贝肝肾功能尚未发育成熟，应尽量避免使用退热药，可采取物理降温措施，如先让宝宝多喝水，必要时还可进行温水浴、用温水擦拭身体等，这些有助于退热。
3.若体温持续升高超过38.5度至39度，可在医生指导下应用对乙酰氨基酚进行退热治疗。
二、病毒感染：
1.3个月小宝贝低烧可能与病毒感染有关，若全身感染中毒症状较轻微且考虑是流感病毒感染，可在医生指导下给予抗病毒药物，如阿昔洛韦等。
2.大部分病毒感染并无特效抗病毒药物，主要进行对症治疗。
三、细菌感染：
1.3个月小宝贝细菌感染时易发生脓毒症、细菌性脑膜炎等，可能引起低烧。
2.这种情况建议及时住院，在医生指导下可静脉使用抗生素进行治疗，如头孢噻肟钠注射液、头孢曲松钠注射液等。
总之，3个月小宝贝出现低烧要重视，根据具体情况采取相应措施，以保障小宝贝的健康。