尿沉淀后出现红色结晶的直接原因是尿液中所含钙和酸根离子过多，不能完全溶解于尿液，从而析出形成草酸钙、碳酸钙、磷酸钙、尿酸钙等结晶物质。这些结晶本身具有一定强度，在随尿液下行过程中，可能会划伤输尿管或尿道，致使少量血液流出并附着在结晶上，进而变成红色结晶。
一、关于尿路有结晶的间接原因：
1.体内钙代谢异常，这可能由各种疾病引起，例如甲状旁腺机能亢进，会导致机体代谢紊乱，使得尿中含钙量增多，更容易与酸根离子结合。
2.患者有痛风情况，导致尿酸排泄增多，易在尿中形成尿酸钙结石。
3.急性肝坏死、白血病、肝细胞性黄疸、胆汁淤积性黄疸等也可能致使机体的钙或其他酸根离子代谢异常，也可能出现红色结晶，不过这种情况一般较为少见。
当尿液沉淀后有红色结晶时，建议多喝水，多吃水果和蔬菜，多运动，以促使小的结晶不在体内沉淀，可随着运动和水的冲刷排出，同时还需针对原发病进行治疗。
总结概况提示：本文主要阐述了尿沉淀后有红色结晶的直接原因是尿液中钙和酸根离子过多形成结晶，结晶可能划伤尿路导致出血形成红色结晶，间接原因包括体内钙代谢异常、痛风等多种疾病，出现这种情况应多喝水等并治疗原发病。