胆总管结石的症状表现多样。大约有60% - 80%的胆总管结石患者会出现上腹部疼痛，这种疼痛多为隐痛或胀痛，有时也会较为剧烈，呈绞痛样。
疼痛症状
右上腹或上腹部隐痛：患者可能会感觉右上腹或者上腹部有隐隐的不适感，这种疼痛可能会持续一段时间，时轻时重。绞痛发作：当结石移动刺激胆总管平滑肌，引起痉挛时，会出现剧烈的绞痛，疼痛可向右肩部或背部放射，发作时患者往往疼痛难忍，坐立不安。
消化道症状
恶心呕吐：不少胆总管结石患者会伴有恶心、呕吐的症状。这是因为结石影响了胆道的正常排空，导致胆道压力升高，反射性引起胃肠道反应。食欲减退：患者可能会出现食欲下降的情况，对食物尤其是油腻食物的消化耐受能力减弱，不想进食。
黄疸表现
皮肤巩膜黄染：当胆总管结石造成胆道梗阻时，胆汁排出受阻，胆红素反流入血，就会出现黄疸。表现为皮肤和巩膜发黄，尿液颜色也会加深，像浓茶一样，而粪便颜色可能会变浅，呈陶土色。一般梗阻不完全时，黄疸可能较轻，完全梗阻时黄疸会逐渐加重。
发热表现
寒战发热：如果胆总管结石引起胆道感染，患者常常会出现寒战、发热的症状。体温可高达38℃ - 39℃甚至更高，这是因为胆道内的细菌感染导致炎症反应，身体出现应激性发热。