孩子发烧39度但精神很好，这种情况并不罕见。主要原因在于孩子年龄小，新陈代谢比成人更活跃，机体全身调节能力更强，大脑皮层兴奋性较高，所以能较好地耐受高体温，使得身体和精神在39度时仍可保持正常活跃。
孩子身体免疫力相对较低，发烧可能由多种因素引起：
一、感染因素，比如病毒或细菌等感染；
1.病毒感染可能引发普通感冒、流感等；
2.细菌感染可能导致扁桃体炎、肺炎等。
二、非感染因素，像风湿等；
三、环境因素，例如降温不当等。
尽管孩子此时精神状态不错，但身体各系统其实处于超负荷运作状态，若不及时处理，很可能引发高热下的惊厥。一般建议可采取以下措施：首先，使用退烧药，如布洛芬、对乙酰氨基酚等进行治疗；其次，进行物理降温，可通过让孩子多喝温水、温水擦身、洗温水澡、贴退热贴等方式。服用退烧药物两个小时后需重新测量体温，若仍处于发烧状态，应及时前往医院儿科就诊。
总之，孩子发烧39度且精神好需引起重视，要密切关注其体温变化并及时采取适当措施，以防出现更严重的情况。