肝区疼痛可能由多种原因引起。比如胆囊炎发作时，约有50%的患者会出现右上腹或肝区的疼痛，疼痛多在进食油腻食物后发作，可向右肩部或背部放射。
肝胆系统疾病导致
肝炎： 病毒性肝炎患者中，约有60% - 80%会出现不同程度的肝区不适或隐痛。肝炎是由病毒感染、药物损伤等多种因素引起肝脏炎症，炎症刺激肝包膜导致疼痛。胆囊炎： 除了右上腹疼痛放射至肝区外，胆囊炎患者还可能伴有恶心、呕吐等症状，进食油腻食物后症状往往加重。
肝脏本身病变引发
肝脓肿： 细菌性肝脓肿患者，通常会有高热，体温可高达39℃ - 40℃，同时伴有肝区持续胀痛，肝脏会有明显肿大，压痛较剧烈。这是由于细菌感染肝脏形成脓肿，刺激周围组织引起疼痛。肝肿瘤： 原发性肝癌患者早期可能仅有轻微肝区隐痛，随着病情进展，疼痛会逐渐加重。肿瘤生长会压迫周围组织或侵犯肝包膜导致疼痛。
邻近组织病变牵涉
胸膜炎： 胸膜炎患者有时也会出现肝区牵涉痛，疼痛往往与呼吸运动有关，深呼吸或咳嗽时疼痛会加剧。这是因为胸膜炎炎症刺激波及到邻近的肝组织周围。膈下脓肿： 膈下脓肿患者会有持续的右上腹或肝区钝痛，同时伴有全身感染症状，如乏力、消瘦等，是由于膈下部位的感染蔓延至肝区周围引起疼痛。