16岁月经不规律，原因可能包括下丘脑-垂体-卵巢轴功能未成熟、精神压力大以及多囊卵巢综合征等。
一、下丘脑-垂体-卵巢轴功能未成熟：16岁的女孩，其下丘脑-垂体-卵巢轴的功能还没有完全发育成熟。在这种情况下，会使卵巢分泌雌激素和孕激素出现不均衡的状况，进而导致月经不规律。这属于正常的生理现象，通常在月经初潮后的3至5年，月经才会逐渐变得有规律。
二、精神压力大：如果16岁女孩面临较大的学习或生活压力，那么很可能会对其内分泌水平产生影响，引发内分泌紊乱。内分泌的紊乱会进一步影响卵巢分泌性激素，导致性激素的分泌失去平衡，最终造成月经不规律的现象出现。
三、多囊卵巢综合征：该病症多在青春期发病，可能与雄激素过多、代谢性紊乱、遗传以及环境等因素相关。当16岁女孩患有多囊卵巢综合征时，由于体内过高的雄激素水平会对排卵起到抑制作用，从而最终致使月经不规律现象的发生。
总之，16岁女孩月经不规律可能由多种原因引起，需结合具体情况进行分析和判断。如果月经不规律的情况持续存在或伴有其他异常症状，应及时就医，以便明确原因并采取相应的治疗措施。