脑干出血通常是由高血压合并细小动脉硬化引起的，约占全部脑出血的10% - 15%。长期高血压会使脑内小动脉形成微动脉瘤，当血压剧烈波动时，微动脉瘤破裂就会导致脑干出血。
高血压因素：
血压控制不稳定： 长期高血压患者如果没有规律服用降压药物，或者在生活中不注意血压监测，血压经常波动，比如血压突然升高到180/110mmHg以上时，就容易引发脑干血管破裂出血。高血压病史较长： 一般来说，高血压病史超过10年的患者，脑干出血的风险会相对更高。因为长期高血压对脑血管的损伤是逐渐累积的，血管壁会变得脆弱，更容易出现破裂情况。
血管病变因素：
脑动脉畸形： 先天性的脑动脉畸形，比如动静脉畸形，血管结构异常，容易在血压波动时发生破裂出血，进而导致脑干出血。这种情况在年轻人中相对常见一些。动脉瘤： 脑内动脉瘤也是导致脑干出血的一个重要血管病变因素。动脉瘤就像血管壁上鼓起的一个“血泡”，当血压升高时，很容易破裂，血液流入脑干就会引起脑干出血。
其他诱发因素：
剧烈运动： 剧烈运动时，身体血压会明显升高，比如进行高强度的竞技体育活动、突然用力搬重物等，都可能使原本脆弱的脑干血管承受不住压力而破裂出血。情绪激动： 人在情绪激动时，像暴怒、过度兴奋等情况，会使得体内交感神经兴奋，血压急剧上升，从而增加脑干出血的发生几率。比如在和人激烈争吵后，就可能诱发脑干出血。寒冷刺激： 寒冷的天气会让人体血管收缩，血压升高，尤其是对于本身有高血压等基础疾病的人来说，在寒冷季节脑干出血的发生率会有所增加。