胎儿酒精综合征是孕妇在孕期饮酒导致胎儿出现的一系列出生缺陷，其表现多样。胎儿酒精综合征的面部特征较为典型，约50%以上的患儿会出现眼裂小、眼距窄、上眼睑褶皱扁平等眼部表现，还可能有短鼻、薄上唇等面部结构异常。
生长发育方面的表现
在生长发育上，胎儿酒精综合征患儿出生时体重可能偏低，出生后身高和体重的增长往往也比正常儿童缓慢。部分患儿在婴幼儿时期就会出现运动发育迟缓的情况，比如抬头、坐立、行走等大运动技能的发育明显落后于同龄儿童。
神经系统的表现
神经系统方面，患儿可能存在智力发育障碍，智力水平通常低于正常儿童。约30% - 50%的患儿会有注意力不集中、多动等问题，在学校学习时可能难以保持专注，影响学业成绩。还有部分患儿会出现癫痫发作的情况，癫痫发作的形式多样，对患儿的神经系统功能会造成进一步影响。
心脏等器官的表现
心脏等器官也可能受到影响，约10% - 20%的胎儿酒精综合征患儿会存在心脏结构异常，像室间隔缺损等先天性心脏病较为常见。此外，泌尿系统也可能出现异常，部分患儿会有肾脏形态或功能的改变。