月经期头痛的原因较多，其中约有60%的女性头痛与雌激素水平变化有关。在月经前后，女性体内雌激素含量波动较大，当雌激素水平下降时，就可能引发头痛。
激素变化因素
雌激素波动影响： 在月经周期中，雌激素的变化较为明显。月经前期雌激素水平逐渐降低，这种波动可能会导致脑血管扩张，从而引发头痛。一般在月经来潮前1 - 2天开始出现相关变化。前列腺素作用： 月经期间，子宫内膜会合成并释放较多的前列腺素。前列腺素除了会引起子宫收缩外，还可能影响脑血管，导致血管收缩或舒张功能紊乱，进而引发头痛。
神经递质因素
5 - 羟色胺影响： 5 - 羟色胺是一种与情绪和疼痛感知相关的神经递质。在月经期，女性体内5 - 羟色胺的代谢可能会发生改变，导致其浓度波动，从而影响神经系统对疼痛的调节，引发头痛。有研究发现，约40% - 50%的经期头痛女性存在5 - 羟色胺代谢异常的情况。内啡肽变化： 内啡肽具有镇痛作用。在月经期间，女性体内内啡肽的分泌可能会减少，使得身体对疼痛的耐受能力下降，更容易出现头痛症状。
个体差异因素
遗传因素： 如果家族中有女性成员在月经期容易出现头痛的情况，那么其他女性成员发生月经期头痛的概率可能会增加。据统计，有家族史的女性中，约70%在月经期更容易出现头痛问题。生活方式因素： 长期睡眠不足、精神压力大的女性，在月经期更容易发生头痛。例如，每天睡眠不足6小时的女性，经期头痛的发生率比睡眠充足女性高约3倍。另外，饮食方面，过多摄入咖啡因的女性，在月经期间也更容易出现头痛症状，因为咖啡因会刺激神经系统，影响血管功能。