HPV6属于低危型人乳头瘤病毒，感染后主要引起生殖器疣等病变。对于HPV6低危型阳性，目前并没有特效药物能直接杀灭该病毒，但可针对相关病变进行处理。
局部病变的物理治疗
激光治疗： 通过激光的高能量烧灼疣体，使其碳化、坏死脱落。一般对于较小的疣体可以选择，操作相对简便，治疗过程中可能会有轻微疼痛，治疗后局部会有创面，需要保持创面清洁干燥，避免感染，通常1 - 2周创面可愈合。冷冻治疗： 利用低温使疣体组织坏死脱落。冷冻治疗后局部可能会出现红肿、水疱等反应，一般1 - 2周水疱会干涸结痂脱落。对于多发的小疣体可以考虑采用冷冻治疗，冷冻治疗后要注意保护创面，防止继发感染。
增强免疫力辅助清除病毒
生活方式调整： 保持充足的睡眠，成年人每天建议保证7 - 8小时的睡眠时间，良好的睡眠有助于机体免疫系统的修复和调节。还要均衡饮食，多摄入富含维生素（如维生素C、维生素E等）和蛋白质的食物，像新鲜的蔬菜水果（橙子、菠菜等）、瘦肉、鱼类等，为机体提供营养支持，增强免疫力。同时要避免熬夜、过度劳累等不良生活习惯，这些会影响免疫力。运动锻炼： 适度的运动可以增强体质，提高免疫力。例如每周进行至少150分钟的中等强度有氧运动，如快走、慢跑等，也可以结合一些力量训练，如瑜伽、俯卧撑等，但要注意运动适量，避免过度运动造成身体损伤。
定期监测
随访观察： 感染HPV6低危型阳性后，要定期进行复查，一般建议每3 - 6个月进行一次醋酸白试验或者HPV检测等。通过定期监测来观察病变是否有变化，以及病毒是否持续存在等情况。如果病变有发展或者病毒持续感染超过1年以上，可能需要进一步的干预治疗。关注自身症状： 要留意生殖器部位是否有新的疣体出现，或者原有疣体是否有增大、增多等情况。如果出现异常症状，要及时就医复诊，以便采取相应的处理措施。