咽神经官能症目前并没有特定的单一药物能完全治愈，常需综合治疗。一般可使用调节神经功能的药物，如维生素B1、谷维素等，部分患者可能会用到抗焦虑抑郁的药物，像多塞平、氟哌噻吨美利曲辛等，但具体用药需根据个体情况由医生决定。
常用调节神经类药物
维生素B1：它是人体代谢所需的重要维生素，能参与神经组织中糖代谢等过程，对维持神经正常功能有帮助，可辅助改善咽神经官能症相关的神经功能紊乱情况。一般来说，成人常用量是一次10毫克，一日3次。谷维素：能调节植物神经功能，减少内分泌平衡障碍，改善精神神经失调症状。通常成人一次10 - 30毫克，一日3次。
抗焦虑抑郁类药物
多塞平：属于三环类抗抑郁药，有抗焦虑和镇静作用，可用于伴有焦虑情绪的咽神经官能症患者。但它可能会引起口干、嗜睡等不良反应，老年人对其敏感性较高，使用时需谨慎。氟哌噻吨美利曲辛：由两种成分组成，小剂量具有抗焦虑和抗抑郁作用，能缓解咽神经官能症患者可能存在的情绪问题。不过，严重心脏疾病、闭角型青光眼等患者禁用。
用药需注意的人群
老年人：老年人肝肾功能有所减退，使用调节神经或抗焦虑抑郁药物时，药物代谢和排泄可能会受到影响，所以用药剂量需要更谨慎，应在医生密切监测下调整剂量。儿童：儿童一般不首选这类药物来治疗咽神经官能症，因为儿童的神经发育尚未完全成熟，药物对他们的影响尚不明确，通常会优先考虑非药物的心理疏导等干预方式。肝肾功能不全者：这类人群使用调节神经或抗焦虑抑郁药物时，药物在体内的代谢和排泄会受到影响，容易导致药物蓄积，加重肝肾负担，所以需要医生评估后谨慎用药，可能需要调整药物种类或剂量。
非药物干预的辅助作用
除了药物治疗，咽神经官能症患者还可以通过心理调节来辅助。比如进行放松训练，像深呼吸放松，每天可以进行几次，每次深呼吸持续5 - 10分钟，能帮助缓解紧张情绪，对改善症状有一定帮助。另外，养成良好的生活习惯也很重要，要保证充足的睡眠，一般成年人需要7 - 8小时的高质量睡眠，同时要避免过度劳累、避免食用辛辣刺激性食物等，这些都有助于病情的改善，可能在一定程度上减少对药物的依赖或辅助药物发挥更好的效果。