咽喉神经官能症目前并没有特定的“最好”药物，治疗多需综合调整。一般可使用调节神经的药物，比如谷维素，它能调节植物神经功能，帮助改善神经功能紊乱相关的症状，通常成人一次10 - 30毫克，一日3次。还可以用维生素B1，它是参与神经代谢的重要物质，成人常用量一次10毫克，一日3次。
调节神经类药物作用
谷维素：能调整自主神经功能，减少内分泌平衡障碍，改善精神神经失调症状，对咽喉神经官能症可能有一定的辅助调节作用。维生素B1：参与体内辅酶的形成，维持正常糖代谢及神经、消化系统功能，缺乏时可能引发神经功能紊乱，补充后有助于神经功能恢复。
对症辅助类药物
含服咽喉含片：比如西瓜霜含片，能起到清咽利喉的作用，缓解咽喉部不适症状。但注意对本品过敏者禁用，孕妇、哺乳期妇女、糖尿病患者及有高血压、心脏病等慢性病严重者应在医师指导下使用。碘喉片：可杀菌消炎，减轻咽喉部的炎症反应，缓解咽喉神经官能症引起的咽部不适，但对碘过敏者禁用。
心理相关调节药物
抗焦虑抑郁药物：如果咽喉神经官能症与焦虑、抑郁情绪密切相关，可能会用到抗焦虑抑郁药。比如黛力新，它是由氟哌噻吨和美利曲辛组成的复方制剂，适用于轻、中度焦虑 - 抑郁状态。但严重心脏病、闭角型青光眼、高度兴奋的患者禁用，孕妇和哺乳期妇女不推荐使用。不过这类药物需在医生严格评估病情后谨慎使用，因为有一定的适应证和禁忌证限制。
特殊人群用药注意
儿童患者：儿童使用调节神经类药物时需谨慎，比如谷维素，儿童用量要根据年龄等因素由医生调整，不能自行随意用药。老年患者：老年患者使用药物时要注意药物的相互作用等情况，像维生素B1，老年患者如果有肝肾功能不全等情况，用药需咨询医生，避免药物不良反应增加。同时，对于含服的咽喉含片，老年患者使用时也要留意是否有过敏等情况发生，并且要按照正确的用法用量来使用。