指甲上有坑可能是由甲真菌病、甲营养不良、银屑病、缺铁性贫血所导致，需要尽快就医以明确原因。
一、甲真菌病：这是因真菌感染而引发的指甲病变。其症状通常表现为指甲表面变得凹凸不平，甲板出现浑浊以及脱落等情况。
二、甲营养不良：是由多种因素致使甲母质的结构与功能发生改变，进而导致甲板在形状、颜色、质地等方面出现异常，其中就可能表现为指甲上有坑。
三、银屑病：这是多种原因引起的慢性鳞屑性皮肤病，脓疱型银屑病会引发指甲的改变，出现点状凹陷、指甲浑浊、指甲分裂等症状。
四、缺铁性贫血：是由于机体缺乏铁而导致的贫血状况，会引发指甲异常，形成匙状甲，也就是指甲中央凹陷，四周隆起，呈现匙状。
总之，一旦发现指甲上存在坑洼，就应当及时进行诊治，遵循医嘱采取相应的治疗措施。