意外怀孕药流是否能流干净，与胚胎的着床位置、大小，以及药流药物的敏感性等多种因素有关，一般存在一定的个体差异，不能一概而论。药流适用于停经49天内的宫内妊娠，且药流前需完善相关检查，无药流禁忌证。药流后需注意观察阴道出血及腹痛情况，一般药流后出血时间为1-2周，若出血时间过长或出血量过多，需及时就医。药流后需注意休息，加强营养，禁盆浴及性生活1个月。药流的成功率为90%左右，药流不全的发生率为10%左右。药流不全可能导致阴道出血时间长、感染、宫腔粘连、月经失调等并发症，严重者可能导致不孕。因此，药流后需注意观察，若药流后出现发热、腹痛、阴道出血量多等异常情况，需及时就医。
需要注意的是，药流有一定的风险，需要在医生的指导下进行。此外，药流前需排除宫外孕，药流后需复查B超，了解药流效果。如果药流失败或药流不全，需要及时进行清宫手术。
对于意外怀孕的女性，如果没有生育需求，建议及时就医，在医生的指导下选择合适的流产方式。同时，要注意保护自己，避免意外怀孕。