甲状腺炎是由多种原因引起的，比如自身免疫因素，约有85%的慢性淋巴细胞性甲状腺炎与自身免疫有关，患者体内会产生攻击甲状腺的自身抗体；感染因素也可能引发甲状腺炎，像病毒感染就比较常见，例如柯萨奇病毒、腮腺炎病毒等感染后，可能会诱发亚急性甲状腺炎，有研究显示约50%的亚急性甲状腺炎患者发病前有病毒感染史；还有遗传因素也有一定影响，某些甲状腺炎具有遗传易感性，若家族中有甲状腺炎患者，其他人患病风险可能相对较高。
自身免疫因素相关
自身抗体产生：人体免疫系统出现异常时，会错误地产生针对甲状腺的自身抗体，这些抗体攻击甲状腺组织，导致甲状腺炎症。比如在慢性淋巴细胞性甲状腺炎中，自身抗体如甲状腺过氧化物酶抗体（TPOAb）、甲状腺球蛋白抗体（TgAb）水平会明显升高，攻击甲状腺细胞，引发炎症反应。遗传易感性体现：研究发现，某些基因变异与自身免疫性甲状腺炎的发生相关。如果家族中有成员患有自身免疫性甲状腺炎，那么家族中的其他成员携带相关易感基因的概率会增加，患病风险也就相对较高，但具体的遗传模式较为复杂，不是单一基因决定的。
感染因素相关
病毒感染引发：当人体感染某些病毒后，病毒可能会影响甲状腺组织。以亚急性甲状腺炎为例，患者发病前往往有上呼吸道感染病史，像感染柯萨奇病毒、腮腺炎病毒等。病毒感染会引起甲状腺组织的免疫反应，导致甲状腺滤泡破坏，释放甲状腺激素进入血液，出现甲状腺功能异常等表现。感染后的免疫反应：病毒感染机体后，免疫系统被激活，免疫细胞会对甲状腺组织进行攻击，同时病毒本身也可能直接损伤甲状腺细胞，从而引发甲状腺炎症。一般来说，病毒感染后的1 - 3周左右可能会逐渐出现甲状腺炎的相关症状。
遗传因素相关
家族聚集现象：在一些甲状腺炎患者的家族中，会发现多人患有类似的甲状腺炎。这表明遗传因素在甲状腺炎的发病中起到一定作用。虽然具体的致病基因尚未完全明确，但家族史是一个重要的风险提示因素。如果家族中有甲状腺炎患者，其他家庭成员应更加关注自身甲状腺健康，定期进行甲状腺功能及相关抗体的检测。遗传与环境的交互：遗传因素并不是单独起作用，而是与环境因素相互作用。即使携带了相关遗传易感基因，如果没有环境因素的触发，可能不会发病。比如有遗传易感性的人，在遇到病毒感染、自身免疫紊乱等环境因素时，就更容易引发甲状腺炎。