治疗细菌性阴炎常用的药物主要是抗厌氧菌药物，一般通过局部用药或全身用药来治疗。比如甲硝唑，它是比较常用的药物之一，一般局部用药的话，甲硝唑阴道泡腾片是常见的，通常7天为一个疗程。
局部用药类
甲硝唑阴道凝胶： 它是局部使用的药物，能直接作用于阴道局部的细菌，抑制厌氧菌的生长繁殖。一般每天一次，睡前使用，将药物挤入阴道深部。使用时要注意保持外阴清洁，用药期间避免性生活。克林霉素磷酸酯凝胶： 也是局部用药，通过抑制细菌蛋白质的合成来发挥抗菌作用。用法同样是局部涂抹于阴道，每天一次，连续使用几天。使用过程中如果出现局部灼烧感等不适，要及时停药并咨询医生。
全身用药类
甲硝唑片： 属于全身用药，可口服。它能抑制厌氧菌的代谢过程，促使其死亡。一般每次服用一定剂量，每天服用几次，连续服用几天。需要注意的是，孕妇在妊娠前3个月一般不建议口服甲硝唑，以免对胎儿产生不良影响，哺乳期女性用药时可能需要暂停哺乳。克林霉素胶囊： 口服后经胃肠道吸收，分布到全身组织和体液中。服用时要按照医生规定的剂量和疗程来用，比如一般一次服用特定剂量，每天服用几次。有胃肠道疾病的患者在服用时要特别留意，可能会出现胃肠道不适等反应。
用药注意事项
过敏人群需谨慎： 对甲硝唑、克林霉素等药物过敏的患者不能使用相应药物。比如有的患者对甲硝唑过敏，用了之后可能会出现皮疹、瘙痒等过敏症状，严重的还可能出现过敏休克等情况。用药期间的卫生： 在使用药物治疗细菌性阴炎期间，要保持外阴清洁干燥，每天用温水清洗外阴，勤换内裤，内裤最好用开水烫洗后在太阳下暴晒，以杀灭病菌。同时，要避免食用辛辣、刺激性食物，以免影响治疗效果。