细菌性阴道炎的治疗药物有多种，其中甲硝唑较为常用。一般来说，甲硝唑可以通过口服或局部用药的方式来治疗细菌性阴炎，通常用药一个疗程（7天左右）能起到较好的治疗效果。
口服类药物
甲硝唑片： 属于硝基咪唑类药物，它能阻碍细菌代谢，促使其死亡。一般建议一次口服0.2 - 0.4克，一天3次，连续服用7天左右。不过，孕妇在怀孕前3个月应避免使用，因为可能会对胎儿产生影响。替硝唑： 也是常用的口服药物，它的抗菌谱与甲硝唑相似，对厌氧菌有较好的抑制作用。通常单次口服2克即可，但有血液疾病的患者要慎用，因为可能会影响血液系统。
局部用药
甲硝唑阴道泡腾片： 直接作用于阴道局部，能有效抑制阴道内的细菌生长。使用时将泡腾片置于阴道深处，每晚1次，一次1片，连续7 - 10天。不过，对甲硝唑过敏的女性不能使用，而且在用药期间要避免性生活。克林霉素磷酸酯凝胶： 局部涂抹能起到抗菌消炎的作用。每天晚上清洗外阴后，取适量凝胶涂抹于阴道内，连续使用7天。有肠道疾病的患者使用时要谨慎，可能会引起肠道不适。
联合用药情况
对于一些病情较为严重或者容易复发的患者，可能会采用口服药物联合局部用药的方式。比如口服甲硝唑的同时，配合使用甲硝唑阴道泡腾片，这样能从全身和局部两个方面抑制细菌，提高治疗效果。但在联合用药前，最好先咨询医生，因为不同患者的身体状况不同，联合用药可能会有一些相互作用需要注意。