多囊卵巢综合征的病因目前尚未完全明确，但主要与以下几方面因素有关。一般认为，遗传因素在其中起到重要作用，据统计，约60% - 70%的患者存在遗传异常。
遗传因素：
家族遗传倾向： 如果家族中有亲属患有多囊卵巢综合征，那么女性成员患病的风险会增加。研究发现，该病具有一定的家族聚集性，可能是由多个基因共同作用，再加上环境因素的影响而发病。例如，若母亲患有多囊卵巢综合征，其女儿患病的几率比正常人群要高很多。
内分泌失调：
下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴调节功能异常： 正常情况下，下丘脑分泌促性腺激素释放激素，刺激垂体分泌促卵泡生成素和促黄体生成素，它们共同调节卵巢的功能。当这个调节轴出现紊乱时，促黄体生成素水平升高，促卵泡生成素水平相对不足，就会影响卵泡的正常发育和排卵，导致卵巢持续产生雄激素，出现多囊卵巢的形态改变以及一系列内分泌紊乱的表现，如月经不调、多毛等。胰岛素抵抗： 约50% - 70%的多囊卵巢综合征患者存在胰岛素抵抗。胰岛素抵抗是指机体对胰岛素的敏感性降低，为了维持正常的血糖水平，胰腺会分泌更多的胰岛素，形成高胰岛素血症。高胰岛素血症又会刺激卵巢分泌更多的雄激素，进一步加重内分泌紊乱和多囊卵巢的症状，还可能导致肥胖等问题。
生活方式因素：
饮食不均衡： 长期高热量、高脂肪、高糖的饮食，会使身体处于代谢紊乱的状态，容易引发肥胖，而肥胖又是多囊卵巢综合征的一个重要诱因。例如，经常大量摄入油炸食品、甜品等，会增加身体的脂肪堆积，影响内分泌系统的正常功能。缺乏运动： 运动量过少会导致身体代谢减慢，脂肪更容易堆积，同时也会影响下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴的调节功能，增加患上多囊卵巢综合征的风险。长期久坐、缺乏体育锻炼的人群，相比经常运动的人，患病几率会更高。