治疗乙肝目前并没有绝对“最好”的药，而是要根据患者具体病情等因素来选择合适药物。一般来说，核苷（酸）类似物和干扰素是常用的抗乙肝病毒药物。例如核苷（酸）类似物中的恩替卡韦，它能抑制乙肝病毒多聚酶，从而抑制病毒复制。
核苷（酸）类似物类药物
恩替卡韦： 对乙肝病毒DNA多聚酶具有抑制作用，可有效抑制病毒复制，长期使用耐药发生率低。一般适用于病毒复制活跃、血清转氨酶ALT持续升高或肝脏组织学显示有活动性病变的慢性乙型肝炎成人患者。替诺福韦酯： 也是一种强效的抗乙肝病毒药物，能通过抑制乙肝病毒逆转录酶来发挥作用，对初治和经治患者都有较好的抗病毒效果，且耐药性发生也较低。
干扰素类药物
普通干扰素： 分为α - 2a、α - 2b等剂型，通过刺激机体免疫系统发挥抗病毒作用，不仅能抑制乙肝病毒复制，还能调节机体免疫功能。但使用时可能会出现流感样症状等不良反应，如发热、头痛、肌肉酸痛等，一般在用药初期较常见，多数人可逐渐耐受。聚乙二醇干扰素： 是普通干扰素的长效制剂，每周给药一次即可，相对于普通干扰素，用药更方便。它同样能抑制乙肝病毒复制并调节免疫，但副作用与普通干扰素类似，不过总体耐受性相对较好一些。
用药需注意的情况
特殊人群： 孕妇、哺乳期妇女使用抗乙肝病毒药物需非常谨慎，必须在医生评估利弊后才能决定是否用药以及选择合适的药物。例如孕妇使用某些核苷（酸）类似物可能会对胎儿产生潜在影响，需权衡病情和药物风险。长期用药者： 长期使用抗乙肝病毒药物的患者需要定期监测肝功能、乙肝病毒DNA定量、肝脏超声等指标，以便及时了解病情变化和药物的疗效及不良反应情况。比如每3 - 6个月需要复查一次相关指标，观察病毒复制是否得到有效抑制、肝脏炎症是否改善等。