孩子发烧、头疼的原因较多，包括感染性因素如神经系统感染、呼吸道感染、胃肠道感染等，以及非感染性因素。
一、感染性因素：
1.神经系统感染：孩子出现化脓性脑膜炎、病毒性脑膜炎等神经系统感染时，会有发烧表现，同时病原体侵犯中枢神经系统导致颅内压升高，进而引发头疼。比如化脓性脑膜炎，这是由化脓性细菌感染引起的脑脊膜炎症，常见致病菌有脑膜炎双球菌、肺炎球菌等，患儿除了发烧、头疼外，还可能出现呕吐、颈项强直等症状；而病毒性脑膜炎主要由肠道病毒、单纯疱疹病毒等引起，除发烧、头疼外，还可能有精神萎靡、嗜睡等情况。
2.呼吸道感染：细菌或病毒引发的感冒发烧，因孩子体温过高可致颅脑血管扩张，从而引起头疼。像普通感冒，多数是由鼻病毒等感染导致，会出现发烧、头疼，还可能伴有鼻塞、流涕等症状；流感则主要是由流感病毒引起，发烧、头疼症状通常更为严重，还可伴有全身酸痛、乏力等。
3.胃肠道感染：主要因病原菌被吞入胃肠道所致，孩子感染后体温调节中枢上移，从而出现发烧、头疼。比如常见的轮状病毒肠炎，患儿除了发烧、头疼，还会有腹泻、呕吐等表现。
4.泌尿系统感染：若孩子存在尿道炎等疾病，在炎症反应较剧烈时，也可能出现发烧、头疼。
二、非感染性因素：一些结缔组织病、肿瘤性疾病等都可能干扰机体免疫系统，造成免疫功能紊乱，刺激体温调节中枢使孩子发烧，同时疾病本身也可能引发头疼。
部分孩子经过退热处理后，头疼能得到缓解。如果孩子发烧头疼，需积极进行对因和对症处理，防止病情进一步发展，以帮助孩子尽快缓解症状。
总之，孩子发烧头疼的原因多样且复杂，要仔细分辨并采取恰当的治疗措施。