纵膈子宫主要是先天性发育异常导致，在胚胎时期，双侧副中肾管融合过程中出现异常，从而形成了子宫纵隔。
先天性发育因素
胚胎发育阶段，双侧副中肾管融合障碍是关键。正常情况下双侧副中肾管应融合形成单一的子宫腔，但若融合过程出现问题，就可能导致纵膈子宫的出现，这是其最主要的成因，且与胚胎早期的发育环境等相关。
遗传因素影响
部分纵膈子宫可能与遗传有关。有研究发现某些遗传基因的异常可能干扰子宫的正常发育过程，增加出现纵膈子宫的风险，不过具体的遗传关联机制仍在进一步探索中。
激素水平影响
在胚胎发育时期，激素水平的异常也可能对子宫发育产生作用。如果相关激素分泌不协调，可能影响副中肾管的正常融合，进而引发纵膈子宫，但这种情况相对遗传因素等来说，不是最主要的直接成因。
其他可能因素
一些外界环境因素在理论上也可能对胚胎发育产生干扰，从而影响子宫的正常形成，不过目前相关证据相对较少。比如孕期母亲接触某些特殊的化学物质等，但这方面还需要更多深入研究来明确其确切关联。对于有纵膈子宫相关情况的人群，尤其是计划怀孕或已怀孕的女性，需要密切关注自身情况，定期进行产检等，以便及时发现问题并采取相应措施。如果存在生育相关困扰等，应及时就医咨询专业医生，医生会根据具体情况进行评估和指导。